Основное ядро научных сотрудников составили находившиеся в то время в эвакуации в Новосибирске такие известные метрологи, как Павел Николаевич Агалецкий, Михаил Константинович Жоховский, Евгений Фролович Долинский. С 1945 г. по 1964 г. институт возглавлял Викентий Викентьевич Варнелло, много сделавший для становления института. Заложенные этими учеными метрологические традиции позволили в дальнейшем создать в институте собственную метрологическую школу. В 1953 г. институт получил новое двухэтажное здание (корпус ОП), а в 1958 г. сдано в эксплуатацию 4-х этажное здание (старый корпус института).
Запросы бурно развивающихся в Сибири промышленности, транспорта, академической науки в послевоенные годы, а также географическое положение г. Новосибирска привели к необходимости создания на базе НГИМИП комплекса эталонов – дублеров основных физических величин. Поэтому особой вехой в развитии института стало постановление Совета Министров СССР от 1 октября 1955 г. о создании в г. Новосибирске второй метрологической базы страны.
В 1968 г. была открыта аспирантура, в том же году институт получил новое наименование «Сибирский Государственный научно-исследовательский институт метрологии».
В 1976 г. было принято новое постановление о создании на базе СНИИМ Сибирского эталонного комплекса, в соответствии с которым, институт получил вторичные эталоны нового поколения практически по всем видам измерений.
В 1984 г. коллектив института за успешное решение задач метрологического обеспечения был награжден орденом Трудового Красного Знамени. К этому времени, в основном в связи с решением задач ВПК, институт стал лидером среди метрологических институтов в области измерений слабых магнитных полей, тепловых потоков, малых длин и углов.
В 1988 г. было закончено строительство нового 12-этажного лабораторного корпуса дублеров государственных эталонов.
1 августа 1989 г. Приказом Госстандарта от 14 августа 1989 г. №327 переименован из Сибирский государственный научно-исследовательский институт метрологии в Сибирский государственный Ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский институт метрологии.
В 1993 г. СНИИМ получил статус Государственного научного метрологического центра (ГНМЦ).
В 2020 году предприятие присоединено к ФГУП "ВНИИФТРИ" в качестве Западно-Сибирского филиала.